اگرچه در آئين‌نامه تركيب شورايعالي هماهنگي ترابري كشور و وظايف و اختيارات آن، مقرر گرديده كه شورا هر پانزده روز يكبار با حضور اعضا تشكيل جلسه دهد و البته اين مصوبه در مراحل اوليه (قبل از انقلاب) و نيز طي دوران جنگ تحميلي كم و بيش انجام مي‌شد، ولي از آنجائيكه اعضاي اصلي شورا بنابر مشغله هاي فراوان خود امكان حضور در تمامي نشستهاي (هر پانزده روز يكبار) شورا را ندارند لذا بموجب مصوبه مورخ 23/8/1360 شورا مقرر گرديده است تا موارد دستور كار شورا بدواً در كارگروهي موسوم به كميسيون فرعي شورا مركب از نمايندگان مطلع اعضاي شورا مطرح و پس از انجام بررسيهاي تخصصي و كارشناسي، مراتب جمعبندي و براي تصميم‌گيري‌ نهايي دستور كار شورا قرار گيرد، كه از آن هنگام تا كنون بر همان مبنا اقدام و ضمن تشكيل جلسات كميسيون فرعي صورتجلسات آن تنظيم و براي اعضا ارسال گرديده و نشستهاي شورايعالي هماهنگي ترابري كشور نيز حسب جمعبندي هاي ارائه شده توسط كميسيون فرعي برگزار مي‌گردد.